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已经发现氢气对人类许多常见疾病具有潜在治疗价值，但研究氢气抗氧化的关键点并不是抗氧化本身。因为能抗氧化的手段和物质太多了，许多维生素都具备这样的作用，氧化还原反应是基本的生物化学过程，具有还原作用的物质几乎都具有抗氧化的作用。
但抗氧化不是越“厉害”越好，蛋白质是生物细胞内具有重要生物功能的物质，是维持和发挥细胞功能的分子。当细胞发生过分氧化的时候，可以发生蛋白功能的损害，例如紫外线可以把蛋白质变性，这是紫外线对皮肤造成损伤的机理之一。相反，强烈的还原物质，是我们经常所讲的抗氧化物质，也可以造成蛋白变性。蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳是一种常使用的分析蛋白质浓度的生物化学手段，由于许多蛋白质是由几个小分子组织经过组合形成的大分子集团，这个方法的基本原理是把组织细胞的所有蛋白质进行变性，变性的化学手段是使用强还原剂，这样可以把小分子之间的化学键短开，形成独立的小分子，然后进行分离和定量分析。蛋白质变性虽然可以方便分析，但变性后许多蛋白质将失去生物学功能，因为蛋白质维持正常功能的前提是形成分子团。所以，还原也并非越强越好。